新航路的開闢為葡萄牙的亞洲拓展提供了客觀條件。葡萄牙商人和耶穌會士的到來，開始了日本近世史上極為重要的中日葡貿易。即以中國澳門為貿易中轉站，葡萄牙商人們將中國的商品源源不斷地運往日本。其中最為重要的交易品當屬中國的生絲。日本耶穌會為了籌措經費維持在日傳教事業的生存和發展，不顧聖職者身份參與到世俗的生絲貿易中來，並從中獲得了可觀的利益，為日本教會提供了足夠的資金。日本耶穌會的參與使原本單純的貿易染上了特殊的色彩，也給教會本身，生絲貿易交流地日本長崎和中國澳門，乃至日本帶來了深遠的影響。