中西文化的核心差異在於雙方在長期歷史進程中形成的不同的社會權力結構：中國是皇權至尊的一元化結構，西方是國王與教皇 (主教) 分治與制衡的二元結構。利瑪竇在《天主實義》中作了明確的表述。對此中國社會是不可能容納的。利瑪竇和他的耶穌會同伴們之所以能夠成功地在17-18世紀的中國居住和傳教，是一系列偶然因素造成的。當時明清政權交替的特殊條件給他們創造了生存空間。當清王朝的統治穩定和鞏固之後，禁教就成為歷史的必然。