正如我們在許多文章中已經證明的那樣，遠東教會的資金問題一直是令教會人士頗為困擾的難題，而長時期入不敷出的財政問題，也在很大程度上影響到傳教工作的進度以及基本模式。在這種情況下，作為附屬於日本教會之下一所相當規模的神學院，澳門聖保祿學院籌措資金的基本方式與主要管道，也就不得不遵循其上級部門的既定方針，接受其制定的相關規章，並由此獲得必需的資金來源。